De toenmalige stichting Colombine te Amsterdam is in 1977 opgericht door Herman van Veen en Joost Taverne met als doel hulp te bieden aan mensen waar ook ter wereld Het motto van de stichting is " De wereld delen" In Thailand, de Filippijnen Indonesia, Kenia, Brazilië en Duitsland is de stichting betrokken geweest bij diverse projecten. Deze landen en werelddelen zijn de inspiratie geweest voor de naam en inrichting van de acht appartementen waar de gasten logeren. De stichting Colombine te Dronten is een zelfstandige voortzetting met als doel de verstrekking van vakantievoorzieningen aan kinderen met fysieke en /of geestelijke problemen. Zij tracht dit doel te bereiken door het verkrijgen van giften, legaten en het geen door erfstellingen worden verkregen, als mede ook door middel van anderen baten.
Het idee van het Colombinehuis is ontstaan tijdens de Colombine actie in 1990 ten bate van Dr. Daniel den Hoedkliniek te Rotterdam. Uit gesprekken met artsen bleek toen, dat er dringende behoefte in Nederland was aan een huis voor kinderen, die rust, ontspanning en geborgenheid nodig hebben. Deze uitdaging werd opgepakt door de stichting Colombine. De opening van het Colombinehuis vond plaats op 22 maart 1997.